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區別：1、InnoDB支持事務，MyISAM不支持；2、InnoDB支持外鍵，而MyISAM不支持；3、InnoDB是聚集索引，而MyISAM是非聚集索引；4、Innodb不支持全文索引，而MyISAM支持全文索引；5、InnoDB支持表、行級鎖，而MyISAM支持表級鎖；6、InnoDB表必須有唯一索引，而Myisam可以沒有；7、存儲文件不同。
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InnoDB：MySQL默認的事務型引擎，也是最重要和使用最廣泛的存儲引擎。它被設計成為大量的短期事務，短期事務大部分情況下是正常提交的，很少被回滾。InnoDB的性能與自動崩潰恢復的特性，使得它在非事務存儲需求中也很流行。除非有非常特別的原因需要使用其他的存儲引擎，否則應該優先考慮InnoDB引擎。
MyISAM：在MySQL 5.1 及之前的版本，MyISAM是默認引擎。MyISAM提供的大量的特性，包括全文索引、壓縮、空間函數（GIS）等，但MyISAM并不支持事務以及行級鎖，而且一個毫無疑問的缺陷是崩潰后無法安全恢復。
mysql中MyISAM和InnoDB的區別：
1. InnoDB支持事務，MyISAM不支持，對于InnoDB每一條SQL語言都默認封裝成事務，自動提交，這樣會影響速度，所以最好把多條SQL語言放在begin和commit之間，組成一個事務；
2. InnoDB支持外鍵，而MyISAM不支持。對一個包含外鍵的InnoDB表轉為MYISAM會失敗；
3. InnoDB是聚集索引，使用B+Tree作為索引結構，數據文件是和（主鍵）索引綁在一起的（表數據文件本身就是按B+Tree組織的一個索引結構），必須要有主鍵，通過主鍵索引效率很高。但是輔助索引需要兩次查詢，先查詢到主鍵，然后再通過主鍵查詢到數據。因此，主鍵不應該過大，因為主鍵太大，其他索引也都會很大。
MyISAM是非聚集索引，也是使用B+Tree作為索引結構，索引和數據文件是分離的，索引保存的是數據文件的指針。主鍵索引和輔助索引是獨立的。
也就是說：InnoDB的B+樹主鍵索引的葉子節點就是數據文件，輔助索引的葉子節點是主鍵的值；而MyISAM的B+樹主鍵索引和輔助索引的葉子節點都是數據文件的地址指針。
4. InnoDB不保存表的具體行數，執行select count(*) from table時需要全表掃描。而MyISAM用一個變量保存了整個表的行數，執行上述語句時只需要讀出該變量即可，速度很快（注意不能加有任何WHERE條件）；
那么為什么InnoDB沒有了這個變量呢？
因為InnoDB的事務特性，在同一時刻表中的行數對于不同的事務而言是不一樣的，因此count統計會計算對于當前事務而言可以統計到的行數，而不是將總行數儲存起來方便快速查詢。InnoDB會嘗試遍歷一個盡可能小的索引除非優化器提示使用別的索引。如果二級索引不存在，InnoDB還會嘗試去遍歷其他聚簇索引。
如果索引并沒有完全處于InnoDB維護的緩沖區（Buffer Pool）中，count操作會比較費時。可以建立一個記錄總行數的表并讓你的程序在INSERT/DELETE時更新對應的數據。和上面提到的問題一樣，如果此時存在多個事務的話這種方案也不太好用。如果得到大致的行數值已經足夠滿足需求可以嘗試SHOW TABLE STATUS
5. Innodb不支持全文索引，而MyISAM支持全文索引，在涉及全文索引領域的查詢效率上MyISAM速度更快高；PS：5.7以后的InnoDB支持全文索引了
6. MyISAM表格可以被壓縮后進行查詢操作
7. InnoDB支持表、行(默認)級鎖，而MyISAM支持表級鎖
InnoDB的行鎖是實現在索引上的，而不是鎖在物理行記錄上。潛臺詞是，如果訪問沒有命中索引，也無法使用行鎖，將要退化為表鎖。
例如：
t_user(uid, uname, age, sex) innodb; uid PK 無其他索引 update t_user set age=10 where uid=1; 命中索引，行鎖。 update t_user set age=10 where uid != 1; 未命中索引，表鎖。 update t_user set age=10 where name='chackca'; 無索引，表鎖。
8、InnoDB表必須有唯一索引（如主鍵）（用戶沒有指定的話會自己找/生產一個隱藏列Row_id來充當默認主鍵），而Myisam可以沒有
9、Innodb存儲文件有frm、ibd，而Myisam是frm、MYD、MYI
Innodb：frm是表定義文件，ibd是數據文件
Myisam：frm是表定義文件，myd是數據文件，myi是索引文件
如何選擇：
1. 是否要支持事務，如果要請選擇innodb，如果不需要可以考慮MyISAM；
2. 如果表中絕大多數都只是讀查詢，可以考慮MyISAM，如果既有讀也有寫，請使用InnoDB。
3. 系統奔潰后，MyISAM恢復起來更困難，能否接受；
4. MySQL5.5版本開始Innodb已經成為Mysql的默認引擎(之前是MyISAM)，說明其優勢是有目共睹的，如果你不知道用什么，那就用InnoDB，至少不會差。
InnoDB為什么推薦使用自增ID作為主鍵？
答：自增ID可以保證每次插入時B+索引是從右邊擴展的，可以避免B+樹和頻繁合并和分裂（對比使用UUID）。如果使用字符串主鍵和隨機主鍵，會使得數據隨機插入，效率比較差。
innodb引擎的4大特性
插入緩沖（insert buffer),二次寫(double write),自適應哈希索引(ahi),預讀(read ahead)
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